ก่อนที่ชินอิจิจะกลายเป็นโคนัน เขาได้รับคำท้าให้หยุดยั้งการลักพาตัวเพื่อนร่วมชั้นให้ได้ ไม่อย่างนั้นเขาจะต้องยอมสูญเสียตำแหน่งนักสืบมัธยมปลาย!